Засновано 1-VII 1928 р. (до цього часу існували н-д. катедра сільсько-господарської ботаніки та Ботан. секція с.-г. наукового комітету України, що роботи їх як спадщина перейшли до Інституту).
Директор Ін-ту проф. В. Любіменко. Структура інституту відповідає розподілу Прикладної Ботаніки на основні її галузі за об'єктами і методами дослідження; відповідно до цього інститут має такі відділи і п/відділи: відділ Прикладної геоботаніки (кер. проф. Л. Раменський) з п/відділами—-Ботанічно-Географічним (кер. Є. Лавренко), Кормових Займищ (кер. проф. Л. Раменський), Меліораційних займищ (кер. проф. д. Віленський), лісових займищ (кер. проф. Г. Висоцький); відділ диких рослин (кер. проф. О. Яната) з п/відділами - Фльор (кер. М. Котів), Корисних диких рослин і Бур'янів (кер. проф. О. Яната); відділ нових культур (кер. проф. В. Вершківський); відділ хлібних та кормових культур (кер. проф. с. Воробйов) з п/відділами- Кормових (кер. проф. О. Супруненко) та Хлібів (кер. проф. С. Воробйов); відділ технічних культур (кер. проф. Я. Савченко) з п/відділами - Олійних (кер. проф. Я. Савченко), Текстильних (кер. проф. В. Ротмістров), Цукрових і Крохмале- вих (кер. проф. Б. Паншин), Наркотичних (кер. М. Ренський), Лікарських, Етерових, Чинбарних, Гумових, Фарбувальних та інш. (кер. проф. В. Вершківський); відділ Городніх та Садових культур (кер. проф. І. Філіпішин) з п/відділами - Городніх (кер. М. Євтущенко), Овочевих і Ягідних (кер. В. Знаменський), Декоративних і Паркових (кер. М. Дейнеко); відділ Лісових порід (кер. проф. 0. Колесніків); відділ Спорових рослин (кер. проф. Л. Шкорбатов); відділ Прикладної Систематики (в. о. кер. проф. О. Яната), з Гербарієм (кер. 6. Лавренко); відділ Фізіології (кер. проф. В. Любіменко) з п/відділами загальної фізіології, біології, екології та фітосоціології (кер. проф. В. Любіменко), Біохемії (кер. проф. Ф. Мацков), Фізіологічного вивчення сортів (кер. А. Кузьменко), Фізіологічної Анатомії (кер. М. Приходько); відділ мікробіології (кер. проф.
