Колишній начальник Хабарівського управління НКВС Гоглідзе та колишній начальник 2 управління НКВС СРСР Федотов, що здійснював безпосередній контроль за роботою „млина“ використовували „млин“ в антидержавних цілях, для фабрикації матеріалів звинувачення на радянських людей.
„Перевірка“ на горезвісному „млинові“ починалася з того, що особі, яка підозрювалася в шпигунстві, або іншій антирадянській діяльності, пропонувалося виконати закордонне завдання органів НКВС. Після отримання від „підозрюваного“ згоди на виконання завдання інсценувалося його закидання на територію Маньчжурії з пункта фальшивої радянської прикордонної застави і затримання японськими прикордонною владою. Потім „затриманий“ передавався в будівлю „Японської військової місії“, де піддавався допиту працівниками НКВС, що виступали в ролі офіційних співробітників японських розвідувальних органів і російських білогвардійців-емігрантів. Допит мав своїм завданням домогтися від „перевіряємого“ визнання „японській владі“ в зв'язку з „радянською розвідкою“, для чого створювалася виключно важкі, розрахована на моральний злам людини умови допиту, застосовувалися різного роду погрози та заходи фізичного впливу.
Багато осіб, штучно вкинутих в незвичайні і важкі для них умови, вважаючи, що вони дійсно перебувають в руках ворогів і в будь-який час можуть бути фізично знищені, розповідали співробітникам НКВС, які виступали в якості японців, про зв'язки з органами НКВС і про ті завдання, що вони отримали для роботи в Маньчжурії. Деякі з цих осіб, залякані смертельною небезпекою, що їм загрожувала, під впливом заходів фізичного впливу повідомляли окремі відомості про Радянський Союз.
Після закінчення допитів, які іноді тривали протягом декількох днів і навіть тижнів, „затриманого“ перевербовували представники „японських розвідорганов“ і закидався на територію СРСР з розвідувальним завданням. Фінал цієї провокаційної гри полягав у тому, що „перевіряємий“ заарештовувався органами НКВС, а потім як зрадник Батьківщини засуджувався Особливою нарадою на тривалі терміни позбавлення волі або до розстрілу.
